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São Joaquim é uma das 13 regiões do Estado de Santa Catarina contempladas no Programa de Aviação Regional da Secretaria de Aviação Civil da Presidência da República. A cidade, juntamente com Balneário Camboriú, foi considerada um dos destinos estratégicos para o turismo nacional, segundo critérios técnicos do Estudo de Competitividade dos 65 Destinos Indutores do Desenvolvimento Turístico Regional, do Ministério do Turismo.A cidade catarinense vai receber melhorias na infraestrutura de seu aeroporto Ismael Nunes, que atualmente não opera voos regulares. O projeto fomenta o turismo no município, conhecido por ser um dos mais frios do Brasil , pelo Parque Snow Valley e pelo cultivo de maçã, principal atividade econômica do Estado. Cerca de 12,5% do PIB de Santa Catarina provém da atividade turística.

O projeto para o aeroporto de São Joaquim está em fase de Estudo Preliminar. As obras incluem a reforma e ampliação da pista de pouso e decolagem e novos terminal de passageiros, pátio de aeronaves e seção contra incêndio.

Situado no Planalto Serrano, o acesso a São Joaquim é, hoje, feito por meio de transporte terrestre ou aéreo pelo aeroporto da capital catarinense, distante 227 km da cidade. Balneário Camboriú será indiretamente beneficiada pelo programa, através das melhorias implementadas pelo programa no aeródromo em Navegantes, localizado a apenas 20 km do município litorâneo.